1、烧根，烧苗，熏棵，死棵

使用发酵不到位的鸡粪后，当达到合适的温度湿度时，鸡粪便开始发酵，发酵产生的热量会烧苗、烂根、黑根、黄叶、黄化，严重时导致植株死亡。尤其是冬春施用鸡粪安全隐患大，因为此时大棚内温度高，鸡粪发酵会散发大量热量，导致烧根现象；果园冬春两季使用鸡粪，正值根系休眠前后，一旦烧根，将影响养分积累和来年开花结果。

2、盐化棚内土壤，果实不开个

连年使用鸡粪，土壤中存留大量的氯化钠盐，平均每6方鸡粪含盐分30-40公斤，而每亩地含10公斤盐分已经严重制约土壤通透性和活性，固化磷肥、钾肥、钙镁锌铁硼锰等重要元素，出现植株生长异常，花蕾稀落，果实不开个等减产现象，显著制约了作物产量和质量的提高。因此造成了肥料利用率直线下降，一年不如一年，增加了投入成本。

3、酸化土壤，诱发各种根际病害和病毒病害

由于鸡粪pH值约在4左右，属于极酸性，会酸化土壤，致使茎基部和根部组织遭受化学创伤和严重破坏，鸡粪携带的大量病毒病菌，在湿度和温度一旦达到就会爆发病害。导致病虫害的传播，滋生病毒病、根腐病、疫病等病害，造成植株萎蔫，黄枯，僵苗、不开个；甚至死亡。病毒病，疫病，茎基腐病，根腐病，青枯病成为使用鸡粪明显的后遗症。

4、滋生根结线虫

鸡粪是根结线虫的宿营地和温床，自身携带根结线虫卵的数量为每1000克100个，鸡粪中的线虫卵极易孵化，一夜之间倍增数万，土壤中的线虫在有鸡粪的地块发生率提高百分之五百倍以上。线虫对化学药剂有极为敏感的趋避性，施药后线虫会迅速转移到地下50公分-1.5米的深处躲避，所以很难治。尤其对于3年以上老棚，根结线虫是致命的隐患之一。

5、带入生素，影响农产品安全

鸡饲养过程中，饲料中国含有大量机素，防治病害也会使用生素，这些都会通过鸡粪带入土壤，影响农产品质量安全。

6、产生有害气体，熏棵、死秧

产生有害气体，熏棵、死秧： 鸡粪在分解过程中产生甲烷、氨气等有害气体，使土壤和作物产生酸害和根系损伤，更严重的是产生的乙烯气体抑制根系生长，也是烧根的主要原因。

7、连年使用鸡粪，造成根系缺氧

连年使用鸡粪，造成根系缺氧：长势不旺： 鸡粪施入土壤中，在分解过程中消耗土壤中的氧气，使土壤暂时性的处于缺氧状态，会使作物生长受到抑制。

8、重金属超标

重金属超标： 鸡粪中含有很高量的铜、汞、铬、镉、铅、砷等重金属，还有较多的机素残留，造成农产品重金属超标，污染地下水源和土壤，有机物向腐殖质转化的时间较长，养分流失严重。