纳豆激酶的一个显著功能便是具有溶解血栓的作用.Mimugu F 等人用血凝块溶解分析法涮定了纳豆激酶的纤溶活性，将之同Plasmin 比较，发现纳豆激酶 的纤溶活性是Plasmin的4倍;MiLsugu.F。将纳豆激酶通过静脉注射到经化学诱导合成的血栓模型时，发现有明显的血栓溶解，并且显示出比纤溶酶和弹性蛋白酶更高的纤溶能力。上述研究表明纳豆激酶 无论是在体外还是在体内，都表现出强的纤溶活性 纳豆激酶 同时可体内的纤维蛋白溶酶原，从而使内源性纤溶酶的量有所增加。另外.健康人口服纳豆激酶之后，出现以下效果: ① 明显地缩短了优球蛋白的溶解时间(ELT); ② 血浆中的纤溶活性提高; ③ 血浆中t-PA量有所增加。由于NK 的安全性，稳定性和良好的溶解血栓的作用，其有可能作为口服试剂用于血栓治疗。